备孕期间禁用抗生素的主要原因如下：1.潜在的不良影响：使用抗生素可能会对受精卵的形成和发育产生一定的影响。有些抗生素会干扰受精卵的正常发育过程，甚至可能导致染色体异常。因此，为了保障胚胎的正常发育，一般不建议在备孕期间使用抗生素。

2. 对菌群平衡的影响：抗生素的作用是杀灭细菌，但它不仅会杀灭致病菌，还会影响人体体内的有益菌群。这些有益菌群对维持生殖系统的健康起着重要作用，一旦被抗生素破坏，可能导致细菌感染的风险增加，从而影响备孕的成功率。

3.药物的副作用： 抗生素在使用过程中可能会产生一些副作用，如肠胃不适、过敏反应等。这些不良反应不仅会影响备孕期间女性的身体状况，还可能对胚胎的发育产生潜在的不良影响。